Ve své nejjednodušší podobě je konfigurační soubor aptitude výčet voleb s jejich hodnotami. Každý řádek souboru by měl mít tvar „Volba Hodnota;“. Například následující ukázka z konfiguračního souboru nastaví volbu Aptitude::Theme na hodnotu „Dselect“.

Aptitude::Theme "Dselect";

Volba může „seskupovat“ další volby. Stačí je zapsat do složených závorek mezi název volby a ukončovací středník:

Aptitude::UI {
  Package-Status-Format "";
  Package-Display-Format "";
};

Volba, která seskupuje další volby se občas nazývá skupina. Ve skutečnosti jsou dvojité dvojtečky v názvech voleb kratším zápisem pro seskupování: Volba Aptitude::UI::Default-Grouping je obsažena ve skupině Aptitude::UI, která je zase obsažena ve skupině Aptitude. Kdybyste tedy chtěli, mohli byste této volbě nastavit hodnotu "" třeba takto:

Aptitude {
  UI {
    Default-Grouping "";
  };
};

Pro více informací o formátu konfiguračního souboru si přečtěte manuálovou stránku apt.conf(5).

Nastavení aptitude je postupně čteno z následujících míst:

Když aptitude potřebuje zjistit hodnotu nějaké volby, prohledává zmíněné zdroje podle uvedeného pořadí, dokud nenalezne její první výskyt. Tato hodnota se použije. Tedy nastavením proměnné v souboru /etc/apt/apt.conf přepíšete implicitní hodnoty programu, ale neovlivníte uživatelovo nastavení v ~/.aptitude/config.

Následujícími konfiguračními volbami můžete ovlivnit vzhled a chování aptitude. Nastavení souvisejících programů naleznete v jejich manuálových stránkách (např. volby systému apt jsou popsány v apt(8) a apt.conf(5)).